FHIR Test Data
The test data
- are freely invented by clinical experts (manually, synthetically) and have no relation to real persons
- have been generated by a tool developed at the University of Leipzig from contributions of different expert groups out of a MS Excel format
- are available for free use as HL7® FHIR® bundles in json format;
- are suitable for direct transfer into a FHIR server
- correspond as far as possible to the core data set of the MII as of 9.11.2020
- however, already contain gaps or errors in the input, which in some cases prevent a successful validation Examples: Medication without ASK code, missing UCUM units.
- can be used by naming the authors, but at least by a reference to this web page of the Leipzig Health Atlas (ToDo).
- Version 3 (24.3.2021): added context (Encounter) reference to MedicationStatement and MedicationAdministration
Die Testdaten
- sind von klinischen Experten frei erfunden (manuell, synthetisch) und haben keinen Bezug zu realen Personen
- sind über ein an der Universität Leipzig entwickeltes Werkzeug aus Zuarbeiten verschiedener Expertengruppen aus einem MS Excel Format heraus erzeugt worden
- stehen in der Form als HL7® FHIR® Bundles im json Format zur freien Verwendung;
- sind für die direkte Übernahme in einen FHIR Server geeignet
- entsprechen weitestgehend dem Kerndatensatz der MII zum Stand 9.11.2020
- enthalten jedoch bereits in der Zuarbeit Lücken bzw. Fehler, die einigen Fällen eine erfolgreiche Validierung verhindern Beispiele: Medication ohne ASK-Code, fehlende UCUM Einheiten
- können unter Nennung der Autoren, mindestens jedoch durch einen Verweis auf diese Web-Seite des Leipzig Health Atlas (ToDo), verwendet werden.
- Version 3 (24.3.2021): added context (Encounter) reference to MedicationStatement und MedicationAdministration
LHA ID: 84T16DWNDK-7
Projects: POLAR - Polypharmacy, Drug Interactions, Risks
Study position:
Study type: Not specified
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Creators and Submitter
Views: 3635
Created: 23rd Nov 2020 at 14:27
Last updated: 24th Jan 2023 at 08:38
Related items
The aim of the project is to use methods and processes of the Medical Informatics Initiative (MII) to contribute to the detection of health risks in patients with polypharmacy. Polypharmacy occurs especially in elderly patients with multimorbidity. Polypharmacy associated with an increased risk for medication errors and drug-drug or drug-disease interactions, which either reduce or intensify the desired effect of individual active substances or lead to undesired adverse drug effects (ADE). In the ...
Programme: MII - Medical Informatics Initiative
Public web page: https://www.medizininformatik-initiative.de/en/POLAR
Test data for POLAR and other use cases
Submitter: Frank A. Meineke
Studies: FHIR Test Data
Resources: General FHIR Test Data, POLAR, Vorhofflimmern
Polar test data for individual workpackages with different FHIR structure.
Submitter: Alexander Strübing
Resource type: Experimental Assay Type
Technology type: Technology Type
Investigation: Test Data
Study: FHIR Test Data
Collection of general FHIR test data
Submitter: Alexander Strübing
Resource type: Experimental Assay Type
Technology type: Technology Type
Investigation: Test Data
Study: FHIR Test Data
Allgemein
Alle einzelnen Datensätze sind aufgeteilt in jeweils (maximal) 1000 Patienten, die jeweils als json.zip und ndjson verfügbar sind.
Die json.zip und ndjson beinhalten jeweils bis zu 1000 Transaktion-Bundles mit jeweils 1 Patienten.
Die gleichnamige Excel-Datei ist die Vorlage zum Generieren JSON-Dateien.
VHF-Testdaten_01
Ursprüngliche Vorhofflimmern (VHF) Testdaten sind Patienten
- unterschiedlichen Alters (17 bis 83 Jahre, davon 3300 Patienten mit Alter > 65 Jahre)
- mit ...
Submitter: Alexander Strübing
Resource type: Experimental Assay Type
Technology type: Technology Type
Investigation: Test Data
Study: FHIR Test Data
Allgemein
Es sind 165 neue Patienten mit den gleichen Patientendaten, aus denen der Datensatz POLAR_WP_1.1_v2 generiert wurde, nur dass zusätzlich jede Condition eine Referenz zum Encounter hat. Da der Encounter selbst auch eine Referenz auf die Condition hat, gibt es hier eine Kreisreferenz, deren Upload einige FHIR-Server ablehnen (z.B. Vonk).
POLAR_WP_1.1_v4a_ReferencesConditionsToEncounter
=
Condition : 330 Consent : 100 Encounter : 330 Medication : 10 MedicationAdministration : 165 ...
Dies sind die originalen Polar-Testdaten. Die Patienten sind aus echten Fällen abgeleitet. 61 Patienten (Patient)
- mit jeweils 1 Einrichtungskontakt (Encounter) und jeweils 1 - 3 Abteilungskontakten (Encounter)
- mit Diagnosen (Condition)
- mit Laborwerten (Observation)
- mit Vitalwerten (Observation)
- mit Prozeduren (Procedure)
- mit Medikation (Medication, Medication Administration, Medication Statement)
Condition : 270 Encounter : 129 Medication : 242 MedicationAdministration : 165 ...
Creators: Alexander Strübing, Jan Erik Gewehr, Friederike Salman, Yvonne Lemke, Norman Freier, Steffen Härterich, Thomas Maulhardt, Martin Böker, Ingolf Cascorbi, Ruwen Böhm, Felix Rottmann, Claudia Bulin, Anna Böhmer, Ulrich Jaehde, Katharina Karsten Dafonte, Martin Coenen, Gunther Hartmann, Martin Fromm, Renke Maas, Pauline Dürr, Melanie Then, Wahram Andrikyan
Submitter: Alexander Strübing
Data file type: Not specified
Allgemein
Alle einzelnen Datensätze sind aufgeteilt in jeweils (maximal) 1000 Patienten, die jeweils als json.zip und ndjson verfügbar sind.
Die json.zip und ndjson beinhalten jeweils bis zu 1000 Transaktion-Bundles mit jeweils 1 Patienten.
Die gleichnamige Excel-Datei ist die Vorlage zum Generieren JSON-Dateien.
VHF-Testdaten_01
Ursprüngliche Vorhofflimmern (VHF) Testdaten sind Patienten
- unterschiedlichen Alters (17 bis 83 Jahre, davon 3300 Patienten mit Alter > 65 Jahre)
- mit ...
Allgemein
Datensatz zum Testen der Polar Workpackages, die jeweils als json.zip und ndjson verfügbar sind.
Die json.zip und ndjson beinhalten jeweils bis zu 1000 Transaktion-Bundles mit 1 Patienten.
Die gleichnamige Excel-Datei ist die Vorlage zum Generieren JSON-Dateien.
POLAR_WP_1.x_v1_MixedTestCasesForAllWorkpackages
Der Datensatz enthält Testfälle für alle Workpackages. Er wird nach Bedarf immer wieder erweitert.
Achtung
DIESE DATEN SIND NICHT KDS-KONFORM. DER VALIDATOR WÜRDE SIE ABLEHNEN.
Sie werden aber zum Testen gebraucht, da einige DIZ-FHIR-Server anscheinend mit solchen unvalidierten Daten bespielt wurden.
Allgemein
Es sind 165 neue Patienten mit den gleichen Patientendaten, aus denen der Datensatz POLAR_WP_1.1_v2 generiert wurde, nur dass hier jede Condition eine Referenz zum Encounter hat, aber der Encounter keine Referenz auf die Condition. Die letzte der beiden Referenzen müsste aber auf
...
Allgemein
Es sind 70 neue Patienten mit den gleichen Patientendaten, aus denen der Datensatz POLAR_WP_1.1_v2 generiert wurde. Jeder Patient hat entweder 2 oder 4 Encounter, wobei einer immer ein Einrichtungskontakt ist und ein weiterer Encounter als Part-Of ein Abteilungskontakt. Die beiden zusammengehörigen Encounter haben immer dieselben Start- und Endzeiten.
Die zusätzlichen Encounter sind alle mit einer jeweils einer Diagnose verbunden, die im Polar Workpackage 1.1 nicht relevant sind.
...
Allgemein
Datensätze sind aufgeteilt in jeweils 1650 Patienten, die jeweils als json.zip und ndjson verfügbar sind.
Die json.zip und ndjson beinhalten jeweils 1000 Transaktion-Bundles mit 1 Patienten.
Die gleichnamige Excel-Datei ist die Vorlage zum Generieren JSON-Dateien.
POLAR_WP_1.1_v2
Generierte Daten aus im Grunde nur 165 Patienten (für jede Diagnose 1 Patient), die verhundertfacht wurden. Details siehe unten.
165 verschiedene Patienten (Patient)
- mit jeweils 1 Einrichtungskontakt ...
Projects: LHA - Leipzig Health Atlas, SMITH - Smart Medical Information Technology for Healthcare, POLAR - Polypharmacy, Drug Interactions, Risks, Management of health information systems, Project Test Demonstrator, NFDI4Health - TA3 Services, NFDI4Health, Methodical Use Case PheP, STOP-NUC, BASALIT
Institutions: Institute for Medical Informatics, Statistics and Epidemiology (IMISE)
https://orcid.org/0000-0002-9256-7543
The medical informatics initiative was created to close the gap between research and healthcare. All of Germany’s university hospitals have joined forces with research institutions, businesses, health insurers, and patient advocacy groups to create a framework that harnesses research findings to the direct benefit of patients. The German Federal Ministry of Education and Research (BMBF) is investing around 160 million euros in the programme through 2021. The digitisation of medicine is creating ...
Projects: Methodical Use Case PheP, SMITH - Smart Medical Information Technology for Healthcare, WP 1.5 of POLAR_MI (Polypharmacy, Drug Interactions, Risks) - Development of risk models, POLAR - Polypharmacy, Drug Interactions, Risks
