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Human Disease

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[Final Report Evaluation Metadata Repository (MDR-Eval)]

Evaluation Metadata Repository

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Metadata Repositories sind Datenbanken für Datenelemente, die sowohl in der Forschung, z.B. in klinischen Studien oder epidemiologischen Kohorten, wie auch in der Versorgung, z.B. in Informationssystemen … des Krankenhauses genutzt werden (können). Bei diesen Datenelementen handelt es sich nicht um die eigentlichen Patientendaten (Fakten), sondern um eine vollständige Definition der verwendeten Variablen bzw. Merkmale inklusive der Kodierung, der Maßeinheit, des Datentyps und anderer Aspekte. In einem BMBF-geförderten und TMF-koordinierten Projekt wurde neben konzeptionellen Grundlagen ein Softwareprototyp für den Aufbau eines Nationalen Metadata Repositories für die klinische und epidemiologische Forschung in Deutschland (MDR) erarbeitet. Der Prototyp implementiert ein Datenmodell nach der aktualisierten Version 3 der ISO/IEC-Norm 11179/3 und steht unter einer Open-Source-Lizenz zur Verfügung . Basis für die realisierten Funktionalitäten des MDRs waren die in einem TMF-Vorprojekt analysierten funktionalen Anforderungen (TMF V063-01 Arbeitspaket 2), welche aber aufgrund der begrenzten Projektmittel nicht vollumfänglich umgesetzt werden konnten. Wesentliche Funktionen wie das Erstellen/Modifizieren/Importieren/Klassifizieren von Datenelementen und Formularen sowie einige der avisierten Community-Funktionen stehen jedoch zur Verfügung. Ziel des hier beschriebenen Projekts MDR-Evaluation war eine Evaluation der möglichen Anwendungsszenarien für Metadata Repositories durch eine größere Gruppe von Fachexperten. Dabei stand nicht eine konkrete Software im Vordergrund, sondern die prinzipielle Erwartung der Community an eine webbasierte Datenbank von Datenelementen. Zur Erreichung des Ziels wurde ein Fragebogen entworfen, der sowohl Fragen zu generellen Aspekten des Aufbaus einer zentralen Bibliothek für Datenelemente der biomedizinischen Forschung wie auch konkretere Punkte im Hinblick auf notwendige Funktionalitäten, gewünschte Inhalte, Werkzeuge zur Communityarbeit und zur Güte von Datenelementen enthielt. Der Fragebogen wurde im Rahmen einer Web-Umfrage einer breiten Community präsentiert. Aus den Antworten lassen sich strategische Erfolgskriterien für die Implementierung eines communityorientierten Metadata Repositories gewinnen.

Author: Matthias Löbe

Date Published: 1st Feb 2015

Publication Type: Not specified

Citation:

Created: 6th May 2019 at 06:58, Last updated: 7th Dec 2021 at 17:58

Tracking Study Patients in a University Hospital Information System

Management of health information systems

(Show All)

Abstract

Not specified

Authors: Sebastian Stäubert, Kirsti Meinel, Frank Meineke, Matthias Löbe, Alfred Winter

Date Published: 2015

Publication Type: InProceedings

Citation: In Digital Healthcare Empowering Europeans of Stud Health Technol Inform, pp. 1010–1011, Eds: Ronald Cornet, Lăcrămioara Stoicu-Tivadar, Alexander Hörbst, Carlos Luis Parra Calderón, Stig Kjær Andersen, Mira Hercigonja-Szekeres, IOS Press, Amsterdam

Created: 10th Nov 2020 at 14:49, Last updated: 7th Dec 2021 at 17:58

Konzeption und Aufbau einer Laborumgebung für die Medizinische Informatik (MI-Lab)

Management of health information systems

(Show All)

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Einleitung: An der Universität Leipzig wird die Studienrichtung Medizinische Informatik als Schwerpunkt im Studiengang Informatik in Kooperation von Medizinischer Fakultät und der Fakultät für Mathematik …

Authors: Sebastian Stäubert, Matthias Löbe, Franziska Jahn, Michael Schaaf, Alfred Winter

Date Published: 2015

Publication Type: Misc

DOI: 10.3205/15gmds064

Citation:

Created: 10th Nov 2020 at 15:09, Last updated: 7th Dec 2021 at 17:58

The Integrated Data Repository Toolkit (IDRT): Accelerating translational research infrastructures

Management of health information systems

(Show All)

Abstract

Journal of Clinical Bioinformatics 2015, 5:S6. doi:10.1186/2043-9113-5-S1-S6

Authors: Christian R. Bauer, Thomas Ganslandt, Benjamin Baum, Jan Christoph, Igor Engel, Matthias Löbe, Sebastian Mate, Hans-Ulrich Prokosch, Ulrich Sax, Sebastian Stäubert, Alfred Winter

Date Published: 2015

Publication Type: Journal article

DOI: 10.1186/2043-9113-5-S1-S6

Citation: J Clin Bioinformatics 5(Suppl 1):S6

Created: 11th Nov 2020 at 12:44, Last updated: 7th Dec 2021 at 17:58

Integrated Repository Toolkit (IDRT) – Werkzeuge zum Betrieb klinischer Data Warehouses auf Basis von i2b2

Management of health information systems

Abstract

Not specified

Authors: Matthias Löbe, Christian Bauer, Benjamin Baum, Johannes Drepper, Thomas Ganslandt, Igor Engel, Sebastian Mate, Hans-Ulrich Prokosch, Ulrich Sax, Sebastian Stäubert, Alfred Winter

Date Published: 2014

Publication Type: Journal article

Citation: mdi 2014(4):43–48

Created: 11th Nov 2020 at 12:44, Last updated: 7th Dec 2021 at 17:58

A Comprehensive Clinical Research Database based on CDISC ODM and i2b2

Management of health information systems

(Show All)

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We present a working approach for a clinical research database as part of an archival information system. The CDISC ODM standard is target for clinical study and research relevant routine data, thus …

Authors: Frank Meineke, Sebastian Stäubert, Matthias Löbe, Alfred Winter

Date Published: 2014

Publication Type: Journal article

Citation: Stud Health Technol Inform 205:1115–1119

Created: 11th Nov 2020 at 12:58, Last updated: 7th Dec 2021 at 17:58

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